ゲノム情報の登録

ゲノム情報をデータベースに登録するのに四苦八苦。

前に甲州ブドウの全ゲノムを解読したときは共同研究者にすべてお任せしていたデータベースへの登録。今回、ラボで新たに読んだ全ゲノムをデータベースに登録するべき、DDBJ D-way にアクセス。で、登録を開始するものの・・・





登録の流れのイメージが全く湧かん!!!

BioSample に、BioProjectに・・・それが終わったらシークエンス・データの登録かぁ。うーーん。DDBJのヘルプやネット上の情報をもとに果敢にチャレンジしたが、なかなか前に進まない。なんか情報が古いのか、少し違うのよね。ボタンも違うし、転送システムもちゃうし、うまくファイルがアップロードできないし。
こうなったら直接入力してやる!ってことで、ファイルから必要な情報を抜き取りそれを入力しながらなんとか前に進んだが、data_validating で何度かエラーを喰らう。めげそう・・・

しかし苦労のかいがあって、エラー・ログを見ながら何とか登録はできたようである。
オートマチックに送られてきた、


Data files of XXXXXXX have been successfully validated.
We start to review your submission.

を見てやり遂げた感満載。

DDBJのチェック、滞りなく終わりますように・・・。